Als CEO, Präsidentin und Chefjuristin von Alliance Defending Freedom (ADF) leitet Kristen Waggoner die glaubensbasierte Menschenrechtsorganisation beim Schutz grundlegender Freiheiten und der Förderung der angeborene Würde aller Menschen in den USA und weltweit. Waggoner beaufsichtigt die Arbeit von mehr als 400 ADF-Mitarbeitern, darunter auch in sieben globalen Büros sowie von 4.500 Partner-Anwälten, die in den Bereichen Rechtsstreitigkeiten, Gesetzgebung, Schulung, Finanzierung und öffentliche Interessenvertretung tätig sind. ADF bietet zudem über 3.500 Kirchen und christlichen Diensten durch das Ministry-Alliance-Programm rechtliche Beratung und verteidigt verfolgte Kirchen und Christen in Dutzenden von Ländern.

Seit 2011 hat ADF 14 Fälle vor dem Obersten Gerichtshof der USA gewonnen, darunter auch die Mitwirkung im juristischen Team von Mississippi in dem Fall, der Roe v. Wade aufhob. Waggoner selbst hat zwei dieser Fälle erfolgreich vor dem Supreme Court verhandelt – Masterpiece Cakeshop v. Colorado Civil Rights Commission und Uzuegbunam v. Preczewski – und hat ihren dritten Fall im Herbst 2022 vor dem Gericht vertreten. International verfügt ADF über eine starke Erfolgsbilanz vor dem Europäischen Gerichtshof für Menschenrechte, den Vereinten Nationen und anderen führenden internationalen Gerichten und Tribunalen. Zudem hat die Organisation erfolgreich die Freilassung Hunderter inhaftierter Christen weltweit erreicht.

Nach ihrer Tätigkeit als wissenschaftliche Mitarbeiterin bei Richter Richard B. Sanders am Obersten Gerichtshof des Bundesstaates Washington trat Waggoner in die Anwaltskanzlei Ellis, Li & McKinstry in Seattle ein, wo sie neun Jahre lang als Partnerin tätig war, bevor sie 2013 zu ADF wechselte. Bei ELM arbeitete sie an Hunderten von Fällen, darunter auch an verfassungsrechtlichen Streitigkeiten wie Stormans v. Wiesman (Gewissensrechte von Apothekern), State ex rel. Gallwey v. Grimm (finanzielle Unterstützung für religiöse Universitätsstudenten) und State v. Hamlin (Seelsorge-/Beichtgeheimnis).

Waggoner ist von Martindale-Hubbell mit dem Peer Review Rating AV® Preeminent™ ausgezeichnet. Sie ist eine gefragte Rednerin zu rechtlichen und kulturellen Themen und kommentiert regelmäßig Fragen der Religionsfreiheit in Fernsehen, Radio und Printmedien.